از دیگر مواردی که پارلمان نقش موثری در تصویب آن دارد موضوع بودجه سالیانه اتحادیه اروپا و تصویب آن می‌‌باشد. معمولاً سیر کار چنین است که هر نهادی برآورد خود را به کميسیون ارسال می‌ دارد و کميسیون بر آن اساس، طرح مقدماتی بودجه را تصویب و آنرا برای شورا ارسال می‌ کند.

شورا بر آن اساس بودجه پیشنهادی را در صورت لزوم اصلاح و با اکثریت لازم به تصویب می‌ رساند. ذکر این نکته ضروری است که در این موارد لازم نیست مانند موارد قبلی حتماً به اتفاق آرا به آن رای موافق داده شده باشد.

پس از آن بودجه پیشنهادی برای پارلمان ارسال می‌ گردد که می‌‌تواند آنرا تصویب، اصلاح و یا رد نماید. در صورت تصویب و یا عدم اتخاذ هر گونه اقدام ظرف مدت 45 روز، بودجه تصویب شده تلقی می‌ گردد.